영덕 대부정합은 약 18억년 전에 생성된 녹색 편암 층과 1억년 전에 생성된 역암 층 사이 17억 년이라는 시간의 공백이 발생한 면이다. 부정합면 아래에서 발견되는 암석의 종류나 암석의 교란을 통해 부정합면 위에 쌓인 지층이 퇴적되기 전에 어떤 지각변동이 일어났는지 유추해 볼 수 있는데 영덕 대부정합은 한반도가 형성되는 과정 중 여러 판의 충돌로 인해 퇴적물이 교란되고 뒤틀린 과정에서 시간 차이가 생긴 것으로 유추해 볼 수 있다.